什么是质粒?盘点质粒提取的方法

普健生物 http://kx.atagenix.cn/ 2022-06-07 

质粒作为载体广泛应用于目的基因的克隆、测序、表达等工作。质粒抽提方法即去除 RNA,将质粒与细菌基因组 DNA分开,去除蛋白质及其它杂质,以得到相对纯净的质粒。

  质粒作为载体广泛应用于目的基因的克隆、测序、表达等工作。质粒抽提方法即去除 RNA,将质粒与细菌基因组 DNA分开,去除蛋白质及其它杂质,以得到相对纯净的质粒。

  理论基础:

  细菌质粒是一类双链闭环的小分子DNA,独立存在于染色体之外,能够进行自我复制。

  提取质粒DNA的方法:

  (一)碱裂解法

  碱裂解法即用碱与SDS从E. coli(大肠杆菌)中分离制备质粒DNA。将细菌悬浮液暴露于高pH值的强阴离子洗涤剂中,使细胞壁破裂,染色体DNA和蛋白质变性,将质粒DNA释放到上清中。在处理时间和强度合适的情况下,当PH值恢复中性时,质粒DNA双链就会再次形成。

  (二)煮沸法

  将细菌悬浮于含有Triton X-100和溶菌酶的缓冲液中,然后加热到100℃破坏细菌外壁、使蛋白质和染色体DNA变性、并解开DNA链的碱基配对。但是。闭环质粒DNA链因为它们的磷酸二酯骨架具有互相缠绕的拓扑结构,所以彼此不会分离。当温度下降后,闭环DNA的碱基又各就各位,形成超螺旋分子。接着离心除去变性的染色体DNA和蛋白质,就可从上清中回收质粒DNA。

  (三)质粒提取试剂盒

  用于大肠杆菌中质粒DNA的小量提取,它结合了优化的碱裂解法,以及方便快捷的硅膜离心技术,具有高效,快捷的特点,能在30min内完成全部操作。

  其中:碱裂解法是从事生物分子学研究的实验室每天都要用到的常规技术,我们一起来看下吧

  碱裂解法质粒抽提

  溶液1:

  50mM葡萄糖/25mMTris-HCl/10mMEDTA,pH 8.0

  溶液2:

  0.2N NaOH/1%SDS

  溶液3:3M醋酸钾/2M醋酸/75%酒精。

  1、接1%含质粒的大肠杆菌细胞于2mlLB培养基。

  2、37℃振荡培养过夜。

  3、取1.5ml菌体于Ep管(离心管),以4000r/min离心3min,弃上清液。

  4:加入0.1ml洛液1(1%葡萄糖,50mM/LEDTA pH8.0,25mM/LTris-HCl pH8.0)充分混台。

  5、加入0.2ml溶液2(0.2mM/LNaOH,1%SDS,轻轻翻转混匀,置于冰浴5min.

  6、加入0.15ml预冷溶液3(5000 mM/LKAc, pH4.8),轻轻翻转混匀,置于冰浴5min。

  7、以10000r/min离心20min ,取上清液于另一新Ep管。

  8、加入等体积的异丙醇,混匀后静置10min.

  9、以10000r/min离心20min,弃上清。

  10、用70%乙醇0.5ml洗涤一次,抽干所有液体。

  11、待沉淀干娱后,溶于50ulTE缓冲液中(或60℃温育去离子水)。

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